More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0631 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 469 aa  978    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  52.22 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  46.72 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  40.14 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  34.04 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  28.02 
 
 		 496 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  29.41 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  30.93 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  29.3 
 
 		 516 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  27.18 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  27.18 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  26.17 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  26.22 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 494 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 494 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  26.57 
 
 		 495 aa  156  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 494 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 494 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  28.24 
 
 		 623 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  28.34 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  26.42 
 
 		 627 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  27.59 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  26.37 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  26.8 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  27.62 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  26.63 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  25.97 
 
 		 492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  25.96 
 
 		 513 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  27.4 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  27.38 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  27.38 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  26.27 
 
 		 507 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  27.14 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  25.36 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  28.04 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  27.09 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.13 
 
 		 517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  24.75 
 
 		 576 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  26.03 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.8 
 
 		 979 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  27.17 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  25.48 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 513 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  25.19 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.95 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.3 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  26.48 
 
 		 654 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.51 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  23.78 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  22.15 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.72 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.15 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  22.47 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.48 
 
 		 1021 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 599 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.23 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.6 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  22.58 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  23.01 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  21.81 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  21.08 
 
 		 532 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 		 836 aa  57  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 631 aa  57  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  22.94 
 
 		 549 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  27.89 
 
 		 561 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.44 
 
 		 593 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  29.53 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  29.53 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  22.81 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  24.61 
 
 		 641 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.66 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.77 
 
 		 574 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  22.73 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  24.88 
 
 		 591 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 778 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  22.32 
 
 		 914 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.55 
 
 		 560 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>