More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2822 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
166 aa  315  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 
161 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 
142 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
173 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 
154 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  33.59 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.15 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
173 aa  57.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.05 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  40.21 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.25 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
164 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.59 
 
 
160 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  38.32 
 
 
140 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
161 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  35.65 
 
 
166 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  36.3 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  43.02 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
172 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
329 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.24 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.48 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
326 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
303 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
325 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  31.36 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  28.21 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
157 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
321 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>