124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0948 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 525 aa  1082    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 522 aa  220  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  25.62 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.69 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.71 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  19.61 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.87 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  26.39 
 
 		 568 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.94 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  25.35 
 
 		 567 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  22.22 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.04 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  23.8 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 505 aa  57  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.61 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  23.59 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 514 aa  54.3  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 531 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.55 
 
 		 430 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 418 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 549 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 552 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.05 
 
 		 511 aa  53.9  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  23.29 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 426 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 426 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 425 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  22.25 
 
 		 558 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 522 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 514 aa  50.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.34 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.11 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  22.17 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.95 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  34.27 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0146  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.49 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.89 
 
 		 544 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.81 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.08 
 
 		 366 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 565 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 565 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 500 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.33 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.33 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>