More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0142 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 359 aa  710    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  35.45 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.28 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.64 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  33.83 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.01 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.91 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.32 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.69 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  37.32 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.28 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  35.55 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.44 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 		 345 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  36.87 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.55 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.9 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  27.59 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.26 
 
 		 268 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.09 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.02 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.34 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  27.56 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  34.75 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 314 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  32.52 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  27.38 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.96 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.97 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.12 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 316 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.3 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  31.16 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  24.37 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  31.64 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.14 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  29.51 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  28.79 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  27.16 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 283 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.74 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.32 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  28.78 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.7 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  30.37 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  26.57 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  24.35 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.48 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.44 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.4 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.84 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.36 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  26.67 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.82 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.03 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.96 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  30.31 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  30.14 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  27.11 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  24.56 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  29.17 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  24.71 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  33.33 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  23.96 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  33.33 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  26.9 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.59 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  27.51 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  26.83 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  29.32 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  27.13 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>