More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2619 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 
156 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  46.67 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  25.37 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  25.37 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  40.31 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  40.31 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  40.31 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
137 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
145 aa  60.8  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.01 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
244 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.81 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  40.7 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  28.78 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>