More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0943 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  306  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
145 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  42 
 
 
145 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
449 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
317 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
317 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  38.93 
 
 
306 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  39.86 
 
 
325 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
324 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.03 
 
 
286 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  39.46 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
297 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.48 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.29 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.86 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
297 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.29 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 
291 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.76 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.33 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.91 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  35.76 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.82 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  31.58 
 
 
287 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.09 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.61 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.12 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  34.51 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  39.56 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.87 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.25 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  34.25 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.06 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.34 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  33.33 
 
 
321 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  30.46 
 
 
287 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  30.46 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.82 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  37.08 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.43 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.51 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.89 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  35.62 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.93 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.56 
 
 
304 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.64 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
287 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  35.57 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.03 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.87 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.43 
 
 
287 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.13 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.25 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.21 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.33 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.97 
 
 
307 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.69 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.69 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.25 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.34 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.87 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  38 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  33.1 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.41 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.41 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.66 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.69 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.43 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  34.39 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.37 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.87 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  33.56 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>