94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0089 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
951 aa  1943    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
998 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 
951 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
961 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
1012 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.04 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
424 aa  64.7  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
450 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 
427 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
424 aa  61.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
426 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
426 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.64 
 
 
428 aa  57.4  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
441 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
420 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
450 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.22 
 
 
422 aa  55.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.22 
 
 
422 aa  55.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
422 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
411 aa  54.7  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
411 aa  54.7  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
411 aa  54.7  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
422 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
427 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 
450 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
403 aa  52.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
416 aa  52.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
410 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 
437 aa  52  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
423 aa  51.6  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 
411 aa  51.6  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
443 aa  51.2  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
466 aa  51.2  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.88 
 
 
411 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
434 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.88 
 
 
366 aa  50.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0255  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
438 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
411 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
420 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
423 aa  50.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
487 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.21 
 
 
450 aa  48.9  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
414 aa  49.3  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
413 aa  48.9  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.66 
 
 
421 aa  48.9  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 
412 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 
428 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
441 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
408 aa  48.5  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.19 
 
 
675 aa  48.5  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.45 
 
 
437 aa  48.5  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.44 
 
 
426 aa  48.5  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
460 aa  48.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
459 aa  48.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
421 aa  48.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 
395 aa  48.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  20.29 
 
 
424 aa  48.1  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
446 aa  47.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.34 
 
 
411 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
440 aa  47.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
455 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 
413 aa  47.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
428 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
397 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
488 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
488 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.4 
 
 
412 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 
431 aa  46.2  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
430 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
410 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
436 aa  46.2  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
423 aa  46.2  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
448 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
430 aa  45.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
443 aa  45.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
419 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.97 
 
 
419 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
408 aa  45.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.5 
 
 
403 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
430 aa  45.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
453 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  29.03 
 
 
430 aa  45.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.07 
 
 
447 aa  45.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
421 aa  45.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 
453 aa  45.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
440 aa  45.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 
419 aa  45.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  23.53 
 
 
464 aa  44.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
451 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
414 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.78 
 
 
440 aa  44.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
449 aa  44.3  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>