114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0294 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 998 aa  2016    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  35.43 
 
 		 951 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 961 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 		 951 aa  361  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 1012 aa  292  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 421 aa  70.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 399 aa  67  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.4 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 411 aa  64.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.26 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 488 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.17 
 
 		 411 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 414 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 488 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 424 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 447 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 415 aa  56.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.25 
 
 		 408 aa  55.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 414 aa  55.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 410 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 422 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.62 
 
 		 442 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 443 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 445 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 427 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 426 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.74 
 
 		 410 aa  52.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 446 aa  52.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 423 aa  52  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 504 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 436 aa  52.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 428 aa  52  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  51.6  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 456 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.48 
 
 		 439 aa  51.2  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 419 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 		 450 aa  51.2  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 428 aa  51.2  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 420 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 434 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 420 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 410 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 439 aa  50.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 445 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 453 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.46 
 
 		 445 aa  51.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 449 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 404 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  20.32 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 416 aa  49.7  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 473 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 430 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 447 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 414 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 382 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 425 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 430 aa  48.9  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 426 aa  48.9  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 391 aa  48.5  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 397 aa  48.5  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 460 aa  48.5  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 458 aa  48.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 425 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  20.78 
 
 		 433 aa  48.5  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  48.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.61 
 
 		 420 aa  48.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 415 aa  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 434 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 429 aa  47.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 391 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 434 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 443 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 423 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 420 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.24 
 
 		 411 aa  47  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 432 aa  47.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 393 aa  47  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.91 
 
 		 366 aa  46.6  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 441 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 542 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 414 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 556 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 429 aa  46.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 421 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 		 425 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>