276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0302 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  100 
 
 		 507 aa  1005    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  41.87 
 
 		 539 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  43.05 
 
 		 562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  47.66 
 
 		 451 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  47.66 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  47.66 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  45.03 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  46.03 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  45.62 
 
 		 451 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  46.25 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  45.48 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  44.9 
 
 		 401 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  40.4 
 
 		 1194 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  45.33 
 
 		 2305 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  36.28 
 
 		 686 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  36.28 
 
 		 686 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  36.28 
 
 		 897 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  36.28 
 
 		 897 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  36.28 
 
 		 897 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  41.35 
 
 		 537 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  37.62 
 
 		 597 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  39.23 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  37.77 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  40.07 
 
 		 358 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  38.26 
 
 		 665 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.09 
 
 		 623 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  37.06 
 
 		 324 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  37.38 
 
 		 324 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  43.12 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  43.75 
 
 		 2310 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  36.74 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  38.05 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.16 
 
 		 526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  38.75 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  35.76 
 
 		 751 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.25 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  35.96 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  37.82 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  32.82 
 
 		 324 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  35.31 
 
 		 543 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  31.58 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  29.11 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.82 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  32.69 
 
 		 591 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  28.04 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.22 
 
 		 548 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  29.25 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  43.88 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  30.23 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  34.35 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  32.14 
 
 		 358 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  39.38 
 
 		 613 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  41.73 
 
 		 467 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 671 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  46.39 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  29.28 
 
 		 521 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  28.78 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  31.71 
 
 		 436 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  42.06 
 
 		 539 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 637 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  42.11 
 
 		 652 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  46.46 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 462 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  42.02 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  30.56 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  29.8 
 
 		 773 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  42.11 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  37.63 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  40.51 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 1055 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  38.14 
 
 		 778 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.96 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.67 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  36.96 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.25 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.89 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.11 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  35.11 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.37 
 
 		 984 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  35.92 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  38.38 
 
 		 847 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  37.25 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.11 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.38 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  35.29 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 		 1128 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  40.66 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  35.11 
 
 		 842 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.89 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  36.23 
 
 		 669 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.04 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>