114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3653 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  100 
 
 		 738 aa  1527    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  41.6 
 
 		 734 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  39.15 
 
 		 764 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  36.2 
 
 		 759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  36.7 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  34 
 
 		 761 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  41.55 
 
 		 829 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  39.34 
 
 		 639 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  41.79 
 
 		 680 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  39.96 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  38.19 
 
 		 445 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  36.73 
 
 		 438 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  36.93 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  35 
 
 		 779 aa  250  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  36.34 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  36.11 
 
 		 782 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  36.11 
 
 		 782 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  35.51 
 
 		 493 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  35.36 
 
 		 782 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  31.98 
 
 		 472 aa  187  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  32.51 
 
 		 659 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  33.64 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  31.19 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  31.07 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  29.42 
 
 		 614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  28.13 
 
 		 445 aa  164  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  31.83 
 
 		 422 aa  161  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  30.22 
 
 		 669 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  29.93 
 
 		 420 aa  159  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  27.49 
 
 		 438 aa  158  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.53 
 
 		 653 aa  153  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  26.17 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  29.55 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  29.55 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.46 
 
 		 691 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  27.24 
 
 		 628 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  29.04 
 
 		 661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  31.61 
 
 		 646 aa  120  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  82  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.3 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  26.17 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  24.23 
 
 		 1006 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  22.88 
 
 		 1034 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  23.24 
 
 		 982 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  22.33 
 
 		 976 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  22.33 
 
 		 976 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  24.05 
 
 		 1034 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  25.57 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  22.01 
 
 		 985 aa  58.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.6 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  22.57 
 
 		 998 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  22.2 
 
 		 1579 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.6 
 
 		 526 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.92 
 
 		 530 aa  55.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  21.71 
 
 		 1039 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1113  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.47 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.327644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.21 
 
 		 709 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.29 
 
 		 722 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  24.63 
 
 		 866 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12081  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.6 
 
 		 567 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0649311  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  23.21 
 
 		 1000 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  23.21 
 
 		 1000 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  28.33 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.17 
 
 		 1095 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 		 707 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.46 
 
 		 728 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  22.72 
 
 		 1100 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.11 
 
 		 724 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  21.48 
 
 		 968 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.33 
 
 		 952 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  21.05 
 
 		 974 aa  48.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  23.62 
 
 		 768 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  30.94 
 
 		 496 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.11 
 
 		 721 aa  47.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.04 
 
 		 705 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.48 
 
 		 705 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.48 
 
 		 705 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.48 
 
 		 705 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  31.03 
 
 		 375 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24.44 
 
 		 573 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  29.33 
 
 		 486 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1406  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000364986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  21.59 
 
 		 952 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.08 
 
 		 732 aa  47  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.48 
 
 		 705 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 705 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.48 
 
 		 705 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  34.48 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.18 
 
 		 718 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30 
 
 		 707 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.15 
 
 		 1102 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1366  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1365  hypothetical protein  25.47 
 
 		 353 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000244018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.33 
 
 		 793 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  29.08 
 
 		 576 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  22.33 
 
 		 814 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1608  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1578  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87864e-41 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.44 
 
 		 474 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  22.73 
 
 		 1025 aa  45.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>