More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5246 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5246  type II secretion system protein E  100 
 
 		 318 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5445  type II secretion system protein E  91.8 
 
 		 318 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0323209  normal  0.0753929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1511  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0020  type IV secretion system protein PilT  36.07 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59340  type IV B pilus protein  34.85 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000971289  hitchhiker  0.00000000000867838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4477  Tfp pilus assembly protein ATPase PilU  34.17 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0066  type IV secretion system protein  35.86 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5915  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  30.17 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  30.63 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  29.75 
 
 		 397 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  29.39 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2719  type II secretion system protein E  31.73 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.616363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  31.8 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  29.83 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  29.35 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  27.63 
 
 		 391 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  30.67 
 
 		 377 aa  99  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  30.93 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  28.57 
 
 		 389 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  32.07 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  32.64 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  32.99 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  29.38 
 
 		 388 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  26.74 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  29.9 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  29.9 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  30.96 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  30.96 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  30.96 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  32.5 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  31.98 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  33.48 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  26.84 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  30.94 
 
 		 403 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  34 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  32.51 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  31.54 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  29.73 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  32.08 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  30.04 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  30.6 
 
 		 375 aa  93.2  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  30.17 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  30.52 
 
 		 389 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  29.51 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  32.1 
 
 		 566 aa  93.2  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  27.9 
 
 		 387 aa  92.8  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  30.99 
 
 		 362 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  28.23 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  30.45 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  32.12 
 
 		 423 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  32.02 
 
 		 360 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  30.71 
 
 		 347 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  32.04 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  30.41 
 
 		 395 aa  92.4  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  32.04 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  31.67 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  31.47 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  32.6 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  33.33 
 
 		 384 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  31.47 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  28.57 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  28.81 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  31.63 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  29.92 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  31.47 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  29.05 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  28.57 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  30.86 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  31.86 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  29.71 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  28.81 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  29.08 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  31.86 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  29.65 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  30.42 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  31.51 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.57 
 
 		 885 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  28.74 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  29.74 
 
 		 397 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  28.52 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  29.8 
 
 		 379 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  31.09 
 
 		 431 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  30.56 
 
 		 402 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  29.88 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  29.28 
 
 		 376 aa  90.1  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  28.75 
 
 		 378 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  27.62 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  33.17 
 
 		 362 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  29 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  28.62 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  30.83 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  29.39 
 
 		 372 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  29.12 
 
 		 375 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  33.19 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  29.65 
 
 		 360 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  31.09 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  28.16 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>