75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 254 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  40.49 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  37.58 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 195 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  47.83 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.9 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.42 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 461 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 219 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 218 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  40.82 
 
 		 233 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 189 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  31.94 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>