178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0429 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  46.2 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  43.35 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  42.37 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  41.42 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.96 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  26.4 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  36.55 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  52.63 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  26.02 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  49.12 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  43.55 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  26.19 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>