171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0841 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.47 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  45.79 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 154 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.95 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 296 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 144 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 158 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30.61 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  29.6 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  27.1 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.51 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.69 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.23 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 157 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 145 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.84 
 
 		 324 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  35.63 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 162 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 162 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 154 aa  45.1  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  24.14 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  38.24 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>