295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7122 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7122  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 220 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  71.36 
 
 		 225 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  75.12 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3610  TetR family transcriptional regulator  75.77 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.3 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  25.88 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  25.76 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  39.71 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  39.71 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  34.34 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  35.35 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>