More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6201 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  360  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  60.53 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  45.25 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  52.17 
 
 		 209 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  47.22 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  46.2 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  45.66 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  40.64 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.02 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  40.49 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  98.6  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 223 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 299 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.98 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  36.9 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 259 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 250 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.92 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.75 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  38.54 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>