215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3493 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  81.68 
 
 		 131 aa  217  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  80.15 
 
 		 131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  78.63 
 
 		 131 aa  210  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  77.1 
 
 		 131 aa  200  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  73.28 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  72.52 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 129 aa  83.6  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.09 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.91 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  25.38 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.11 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  25.55 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  27.86 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  24.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  24.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  27.42 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  29.51 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  30.43 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  26.95 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  32.18 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  32.18 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  32.18 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  38.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  32.97 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  27.34 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>