More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0559 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 788 aa  1509    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.58 
 
 		 836 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  40.81 
 
 		 695 aa  331  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 845 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 832 aa  279  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 843 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 833 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 818 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  39.26 
 
 		 794 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 956 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 845 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  42.37 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  44.16 
 
 		 937 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 967 aa  58.9  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.85 
 
 		 913 aa  58.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.09 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 910 aa  57.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 1074 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 982 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 208 aa  57.4  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2925  transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 517 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 210 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  41.05 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 217 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  42.19 
 
 		 228 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  48.21 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 258 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 765 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 217 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 206 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 421 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 218 aa  55.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 262 aa  55.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  42.19 
 
 		 227 aa  55.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  55.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 218 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  46.03 
 
 		 233 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 1030 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 226 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 956 aa  55.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  49.02 
 
 		 963 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  46.38 
 
 		 567 aa  55.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 973 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.1 
 
 		 517 aa  54.7  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 993 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  37.18 
 
 		 943 aa  54.7  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  54.7  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  45.1 
 
 		 923 aa  54.7  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  44.83 
 
 		 921 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  42.11 
 
 		 900 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 204 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  50.94 
 
 		 202 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 232 aa  54.3  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 203 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  45.61 
 
 		 929 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.67 
 
 		 216 aa  54.3  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.78 
 
 		 947 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  54.3  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 		 229 aa  54.3  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.08 
 
 		 919 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 226 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 213 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  50.98 
 
 		 799 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  40 
 
 		 916 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 216 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.94 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  44.64 
 
 		 232 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 225 aa  54.3  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 222 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  49.15 
 
 		 977 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  40.22 
 
 		 964 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 889 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 893 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40 
 
 		 222 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 223 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 755 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>