167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3616 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 1041 aa  2102    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  97.21 
 
 		 1041 aa  1925    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  97.21 
 
 		 1041 aa  1925    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  74.68 
 
 		 1012 aa  1519    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  25.94 
 
 		 982 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.47 
 
 		 1078 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.69 
 
 		 1028 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  20.22 
 
 		 1060 aa  85.1  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  19.88 
 
 		 1087 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  21.81 
 
 		 1072 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  20.71 
 
 		 1048 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.49 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.88 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.56 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  26.18 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  31.09 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.28 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  30.65 
 
 		 1005 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  39.58 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.47 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  21.38 
 
 		 918 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 425 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 428 aa  57  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 427 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  30.77 
 
 		 449 aa  56.2  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  26.85 
 
 		 445 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 430 aa  55.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.63 
 
 		 428 aa  55.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  30.91 
 
 		 442 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  30.91 
 
 		 442 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  30.91 
 
 		 442 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  25.51 
 
 		 403 aa  55.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.06 
 
 		 443 aa  55.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  55.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  23.96 
 
 		 432 aa  55.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.12 
 
 		 436 aa  54.7  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 434 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 434 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  30.12 
 
 		 441 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 434 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 421 aa  54.3  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  22.88 
 
 		 408 aa  54.3  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  31.08 
 
 		 441 aa  54.3  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 442 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.22 
 
 		 437 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 432 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  30.48 
 
 		 1067 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.86 
 
 		 590 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 442 aa  53.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 432 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  37.11 
 
 		 1167 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 426 aa  53.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  52.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 432 aa  52.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  31.97 
 
 		 440 aa  52.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 441 aa  52.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  30.97 
 
 		 433 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 433 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  30.2 
 
 		 431 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 449 aa  52  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.85 
 
 		 440 aa  51.6  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  30.2 
 
 		 431 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 442 aa  51.6  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  26.83 
 
 		 461 aa  51.6  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  28.12 
 
 		 450 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.2 
 
 		 457 aa  51.6  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  27.85 
 
 		 443 aa  51.6  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 442 aa  51.6  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.24 
 
 		 1014 aa  51.6  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  25.2 
 
 		 313 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  27.34 
 
 		 433 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 450 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  28.76 
 
 		 430 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  33.58 
 
 		 509 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 431 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.95 
 
 		 462 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 450 aa  50.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  27.54 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  26.56 
 
 		 423 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  26.56 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  27.22 
 
 		 444 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 450 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.97 
 
 		 316 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  27.34 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 430 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  27.34 
 
 		 419 aa  49.7  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  27.34 
 
 		 419 aa  50.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.11 
 
 		 512 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1042 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 431 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  30.39 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  30.39 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  30.93 
 
 		 1010 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  37.23 
 
 		 1117 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  22.04 
 
 		 408 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>