More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2267 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  92.81 
 
 		 334 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  91.92 
 
 		 334 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  62.73 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  50.31 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  50.15 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  40.75 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.96 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 313 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 234 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.93 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 305 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  36.33 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 239 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 214 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.94 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.1 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.25 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>