More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3715 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
739 aa  1523    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  49.15 
 
 
1833 aa  240  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  44.32 
 
 
1845 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  45.15 
 
 
355 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  39.21 
 
 
1712 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
640 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  45.67 
 
 
1837 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  43.04 
 
 
355 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
803 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
427 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
515 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  46.96 
 
 
1822 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  38.92 
 
 
1697 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
1000 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
851 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
657 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
975 aa  211  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
713 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  31.46 
 
 
468 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  40.87 
 
 
1809 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
875 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
666 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  42.74 
 
 
357 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  40.34 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  42.04 
 
 
356 aa  202  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
886 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  42.27 
 
 
225 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
733 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
963 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
914 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
759 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
495 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  39.68 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  41.56 
 
 
358 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
902 aa  191  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
636 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
484 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
784 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1040 aa  188  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
845 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
748 aa  187  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
471 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
902 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  40.41 
 
 
1836 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
779 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  40.68 
 
 
356 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
796 aa  181  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  64.52 
 
 
637 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
538 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0037  sensor histidine kinase  39.83 
 
 
337 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
799 aa  177  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
624 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
1211 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
978 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1211 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
632 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
501 aa  172  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
773 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1322 aa  171  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
839 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 
968 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
501 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.7 
 
 
823 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
1744 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.23 
 
 
1748 aa  167  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  27.69 
 
 
758 aa  167  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
616 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
842 aa  164  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
487 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
513 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
635 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.77 
 
 
532 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  32.63 
 
 
1053 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  33.97 
 
 
1685 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  37.55 
 
 
811 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
556 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
503 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  39.04 
 
 
440 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
858 aa  160  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
553 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
524 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1697  histidine kinase  35.39 
 
 
317 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000828952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 
2077 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
369 aa  157  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.01 
 
 
2109 aa  157  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
870 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.24 
 
 
857 aa  156  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
508 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
510 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
534 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
398 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
515 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>