More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3809 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 216 aa  248  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  42.08 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  44.61 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  48.12 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  42.63 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 167 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 403 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  47.54 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  30.39 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  38.2 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  44.68 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  27.19 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 183 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>