More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0550 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  100 
 
 
356 aa  718    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  77.59 
 
 
396 aa  564  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  71.02 
 
 
362 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  67.61 
 
 
362 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  66.57 
 
 
366 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  67.51 
 
 
432 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  57.34 
 
 
375 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  53.8 
 
 
387 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  53.51 
 
 
383 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  54.2 
 
 
427 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  54.2 
 
 
427 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.91 
 
 
437 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  54.2 
 
 
427 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  53.8 
 
 
383 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  53.51 
 
 
383 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  53.41 
 
 
366 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  52.05 
 
 
388 aa  361  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  51.72 
 
 
366 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  52.02 
 
 
386 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  54.83 
 
 
383 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  51.4 
 
 
358 aa  358  9e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  51.88 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  52.05 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  51.99 
 
 
359 aa  354  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  49.4 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  47.91 
 
 
372 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  47.97 
 
 
351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  50.74 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  47.66 
 
 
365 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.55 
 
 
397 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  47.08 
 
 
375 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  50.15 
 
 
360 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.57 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.08 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.09 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.08 
 
 
366 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.78 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  48.48 
 
 
344 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.75 
 
 
351 aa  318  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  48.39 
 
 
368 aa  319  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.08 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  46.63 
 
 
358 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.12 
 
 
339 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  47.37 
 
 
368 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  46.78 
 
 
363 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.51 
 
 
370 aa  315  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  46.78 
 
 
365 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  46.65 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  46.2 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  51.44 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  47.13 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  45.87 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  46.78 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  46.49 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.12 
 
 
366 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  44.61 
 
 
358 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  46.2 
 
 
366 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  48.67 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.16 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  48.05 
 
 
382 aa  308  8e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  48.62 
 
 
351 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  45.98 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  47.16 
 
 
350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  47.79 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.38 
 
 
360 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  44.99 
 
 
358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  43.64 
 
 
388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  45.03 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.78 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  45.95 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  44.7 
 
 
374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  46.36 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  49.25 
 
 
566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.06 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.39 
 
 
347 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  49.7 
 
 
372 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  46.41 
 
 
352 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  46.99 
 
 
347 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  47.15 
 
 
345 aa  298  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  43.27 
 
 
372 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  45.93 
 
 
430 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  43.19 
 
 
374 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.15 
 
 
345 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  45.48 
 
 
349 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.78 
 
 
345 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.35 
 
 
344 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  47.15 
 
 
345 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.69 
 
 
344 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  47.83 
 
 
345 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  46.42 
 
 
347 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.1 
 
 
347 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.24 
 
 
345 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  46.55 
 
 
345 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.05 
 
 
344 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  41.48 
 
 
370 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  45.54 
 
 
347 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  46.25 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.18 
 
 
347 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  46.25 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  45.71 
 
 
344 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>