More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2315 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 503 aa  1038    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  58.75 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  57.34 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 445 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  32.57 
 
 		 422 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.89 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 420 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.61 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 449 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 420 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 393 aa  94.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.33 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 413 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 403 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.37 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.86 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.52 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.46 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.46 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 925 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  36.92 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.88 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.33 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.82 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.92 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>