More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0083 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
2240 aa  4564    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
2262 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.39 
 
 
1676 aa  440  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
2262 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
1694 aa  393  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
4079 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 
878 aa  267  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
927 aa  254  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 
1056 aa  246  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.53 
 
 
810 aa  246  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.07 
 
 
1979 aa  243  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
1022 aa  233  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.73 
 
 
988 aa  232  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.5 
 
 
3172 aa  224  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
1737 aa  222  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
1276 aa  221  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.65 
 
 
2059 aa  218  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.8 
 
 
1056 aa  218  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.7 
 
 
1056 aa  201  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
1069 aa  195  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
818 aa  192  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.41 
 
 
936 aa  189  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
1297 aa  187  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
750 aa  184  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.18 
 
 
2145 aa  177  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.71 
 
 
1138 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.73 
 
 
887 aa  173  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.77 
 
 
784 aa  172  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
847 aa  171  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
909 aa  169  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
486 aa  166  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.21 
 
 
3145 aa  163  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
1049 aa  162  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
1486 aa  161  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
543 aa  159  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
1421 aa  159  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
3301 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
562 aa  157  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.22 
 
 
1067 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
566 aa  155  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.64 
 
 
1154 aa  152  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 
632 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
465 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 
564 aa  150  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
602 aa  150  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.1 
 
 
573 aa  149  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
573 aa  148  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
505 aa  146  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.69 
 
 
725 aa  145  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.95 
 
 
837 aa  145  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
860 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.86 
 
 
816 aa  144  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.83 
 
 
732 aa  143  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
685 aa  142  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.03 
 
 
733 aa  141  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
617 aa  140  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 
758 aa  140  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 
784 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
804 aa  139  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.67 
 
 
1013 aa  138  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 
883 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.39 
 
 
462 aa  137  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
634 aa  137  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 
643 aa  136  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.01 
 
 
864 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
884 aa  135  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 
681 aa  134  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.61 
 
 
795 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
605 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.9 
 
 
573 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
450 aa  134  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
594 aa  134  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
649 aa  133  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 
448 aa  134  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.11 
 
 
745 aa  133  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.58 
 
 
882 aa  133  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
687 aa  132  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
566 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
828 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 
591 aa  131  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
711 aa  131  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 
572 aa  127  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
637 aa  127  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
568 aa  128  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
824 aa  127  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
935 aa  127  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
828 aa  126  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 
632 aa  126  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.66 
 
 
1213 aa  126  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.96 
 
 
594 aa  126  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
448 aa  126  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
767 aa  125  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.76 
 
 
865 aa  125  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
792 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.9 
 
 
706 aa  124  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.93 
 
 
573 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
366 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.99 
 
 
832 aa  124  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1371 aa  124  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.88 
 
 
707 aa  123  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>