More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1169 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 384 aa  769    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  56.36 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  54.59 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  49.35 
 
 		 379 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.22 
 
 		 386 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.96 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  44.86 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.23 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.91 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  49.69 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  44.38 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.19 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.93 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.19 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  47.89 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  46.5 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41.19 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.94 
 
 		 476 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  47.68 
 
 		 461 aa  278  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.48 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  43.85 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.21 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.06 
 
 		 478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.21 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.15 
 
 		 475 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  45.97 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.82 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  42.28 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.75 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  48.2 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  43.99 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.73 
 
 		 464 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.62 
 
 		 475 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  41.33 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.64 
 
 		 476 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.41 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.74 
 
 		 481 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  42.64 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  47.27 
 
 		 457 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  45.9 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.45 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  41.33 
 
 		 514 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.2 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.21 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.5 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  45.34 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  43.84 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  45.34 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  47.58 
 
 		 458 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  46.36 
 
 		 518 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  43.88 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  45.43 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  45.43 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  38.64 
 
 		 415 aa  256  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.95 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.68 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.45 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.99 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  42.94 
 
 		 473 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.39 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  44 
 
 		 492 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.29 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.62 
 
 		 503 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  41.35 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  41.35 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  40.33 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.95 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  43.62 
 
 		 495 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.84 
 
 		 478 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  39.71 
 
 		 537 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  42.6 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  40.95 
 
 		 481 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.69 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  41.07 
 
 		 396 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.33 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  40.31 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.43 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  42.01 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.89 
 
 		 504 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  44.35 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.41 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.94 
 
 		 588 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  40.42 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  39.57 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.29 
 
 		 502 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  40.44 
 
 		 528 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  42.41 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  42.41 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.53 
 
 		 513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  44.21 
 
 		 500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  42.99 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.09 
 
 		 473 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.64 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  43.03 
 
 		 495 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>