More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3385 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 910 aa  1861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 907 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 875 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 907 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 953 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 935 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 935 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 935 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 930 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 930 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 930 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 935 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 869 aa  317  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 871 aa  317  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 937 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 933 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 966 aa  312  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 852 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.48 
 
 		 936 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 965 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 857 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 869 aa  303  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 912 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 873 aa  300  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 944 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 841 aa  299  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 836 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  30.07 
 
 		 839 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 873 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 861 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 861 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 861 aa  295  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 855 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 897 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 842 aa  290  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 847 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 981 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 901 aa  287  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 849 aa  286  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 843 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 879 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 948 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 855 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 904 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 940 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 924 aa  282  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 869 aa  281  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 872 aa  278  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 891 aa  277  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 904 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 838 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 904 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 904 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.86 
 
 		 853 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 855 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 894 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 950 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 985 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 890 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 893 aa  269  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 974 aa  268  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 874 aa  268  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 938 aa  268  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 890 aa  267  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.89 
 
 		 880 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 890 aa  267  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 957 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 901 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  28.42 
 
 		 899 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 952 aa  265  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 951 aa  265  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 935 aa  264  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 895 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 987 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 975 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 981 aa  260  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 896 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.25 
 
 		 969 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 876 aa  257  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 944 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 883 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 883 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.15 
 
 		 827 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 868 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 944 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.16 
 
 		 884 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 883 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 817 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 909 aa  251  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 956 aa  251  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 928 aa  251  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 929 aa  250  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>