More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0382 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  84.54 
 
 
2768 aa  1303    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.94 
 
 
6683 aa  2159    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  40.65 
 
 
6662 aa  2113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.65 
 
 
4122 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  67.86 
 
 
7149 aa  815    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  60.83 
 
 
2239 aa  1334    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  39.4 
 
 
4678 aa  2122    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  40.82 
 
 
6779 aa  2136    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.67 
 
 
4836 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  97.19 
 
 
5442 aa  2585    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  56.18 
 
 
4791 aa  2680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.75 
 
 
5787 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  41.2 
 
 
4214 aa  1094    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
5839 aa  10950    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.03 
 
 
2812 aa  626  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  29.65 
 
 
4874 aa  592  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  60.49 
 
 
4285 aa  582  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.65 
 
 
4220 aa  446  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.13 
 
 
5171 aa  442  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  42.95 
 
 
5218 aa  437  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.58 
 
 
5962 aa  424  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  35.91 
 
 
6715 aa  417  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  41.68 
 
 
6753 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  40.06 
 
 
8682 aa  390  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  39.77 
 
 
9030 aa  391  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.34 
 
 
4848 aa  370  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  44.43 
 
 
16322 aa  345  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  33.59 
 
 
1461 aa  320  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  32.32 
 
 
4689 aa  309  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  37.61 
 
 
3259 aa  298  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  61.27 
 
 
5444 aa  243  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  49.63 
 
 
2251 aa  221  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.57 
 
 
5745 aa  209  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  47.58 
 
 
606 aa  207  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.37 
 
 
5559 aa  199  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  31.71 
 
 
5561 aa  198  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.27 
 
 
1597 aa  197  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  32.14 
 
 
5561 aa  197  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  31.63 
 
 
5559 aa  196  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.41 
 
 
5561 aa  195  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.96 
 
 
1599 aa  194  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  41.71 
 
 
3182 aa  175  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.71 
 
 
3562 aa  172  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.63 
 
 
3204 aa  169  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.2 
 
 
4978 aa  161  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.1 
 
 
2542 aa  160  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  29.64 
 
 
3516 aa  155  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.54 
 
 
1884 aa  141  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.24 
 
 
3191 aa  137  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.43 
 
 
3721 aa  133  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  46.63 
 
 
1699 aa  129  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.38 
 
 
3325 aa  128  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.13 
 
 
3824 aa  127  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 
1553 aa  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.73 
 
 
2067 aa  126  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  31.78 
 
 
1706 aa  122  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.08 
 
 
3314 aa  121  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27 
 
 
3824 aa  122  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  26.88 
 
 
3824 aa  120  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.34 
 
 
3363 aa  119  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  39.06 
 
 
8321 aa  118  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.53 
 
 
1166 aa  117  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  26.88 
 
 
3739 aa  117  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.39 
 
 
814 aa  116  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.34 
 
 
4106 aa  113  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.52 
 
 
1269 aa  113  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  38.5 
 
 
3229 aa  112  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27 
 
 
2911 aa  111  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.45 
 
 
4854 aa  110  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.56 
 
 
5080 aa  108  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.34 
 
 
3927 aa  108  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.08 
 
 
4430 aa  108  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 
2812 aa  107  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.82 
 
 
3552 aa  107  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  31.03 
 
 
1268 aa  106  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.58 
 
 
739 aa  105  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  31.88 
 
 
1269 aa  105  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  27.47 
 
 
2890 aa  105  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  38.22 
 
 
2887 aa  103  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  35.87 
 
 
686 aa  102  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  42.94 
 
 
813 aa  102  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  43.71 
 
 
2524 aa  102  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 
1428 aa  100  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 
2336 aa  99.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.58 
 
 
2816 aa  99.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.44 
 
 
485 aa  100  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.93 
 
 
2704 aa  99  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  32.46 
 
 
3477 aa  99  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.18 
 
 
9867 aa  98.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.21 
 
 
2807 aa  99  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31.57 
 
 
3508 aa  98.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  28.27 
 
 
2456 aa  97.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.23 
 
 
2346 aa  96.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  51.22 
 
 
2452 aa  97.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.28 
 
 
2767 aa  95.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.95 
 
 
2555 aa  94.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.63 
 
 
3734 aa  94  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 
467 aa  94  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  58.82 
 
 
855 aa  93.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.01 
 
 
2927 aa  93.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>