177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1365 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 322 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  99.21 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  95.65 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  94.86 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  71.43 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 		 258 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  68.78 
 
 		 258 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  62.7 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  62.3 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.61 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.2 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  22.69 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.88 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  23.47 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  22.89 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  25.81 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  19.25 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.03 
 
 		 860 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  20 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  22.86 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  22.86 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  22.38 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  23.2 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 843 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.08 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  22.54 
 
 		 714 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  19.8 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.49 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  19.51 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.5 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  25.12 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  24.44 
 
 		 736 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 2035 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  19.11 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  23.36 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 946 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  22.5 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  21.76 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.14 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  19.91 
 
 		 502 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  19.91 
 
 		 502 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  21.84 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  23.68 
 
 		 250 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  20.7 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  22.94 
 
 		 727 aa  49.3  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  19.91 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  22.91 
 
 		 256 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.94 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  22.48 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 1080 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  22.22 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  21.53 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  24.2 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  21.96 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.79 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  23.7 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.3 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  25 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 893 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  20.87 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.35 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  21.7 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1410 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  22.92 
 
 		 565 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  31 
 
 		 458 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.08 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  23.53 
 
 		 245 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.22 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.83 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  20.9 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 618 aa  46.2  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.46 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>