234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2896 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  73.37 
 
 		 528 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  100 
 
 		 722 aa  1472    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  85.87 
 
 		 722 aa  1209    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  49.93 
 
 		 738 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  44.08 
 
 		 679 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  42.79 
 
 		 589 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  39.84 
 
 		 596 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  41.11 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  45.53 
 
 		 707 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  44.01 
 
 		 479 aa  352  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 566 aa  349  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  42.37 
 
 		 494 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  37.94 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  38.34 
 
 		 612 aa  323  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  40.09 
 
 		 470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  37.06 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  40.74 
 
 		 914 aa  318  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  38.06 
 
 		 688 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  34.59 
 
 		 551 aa  273  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  35.06 
 
 		 661 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.51 
 
 		 1888 aa  260  8e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.33 
 
 		 2156 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  28.53 
 
 		 458 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 		 453 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  30.87 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 439 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  45.1 
 
 		 661 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  49.46 
 
 		 881 aa  95.1  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.64 
 
 		 739 aa  94.4  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  48.39 
 
 		 881 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  48.39 
 
 		 882 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.39 
 
 		 882 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  49.04 
 
 		 385 aa  92  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 461 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  22 
 
 		 767 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  27.78 
 
 		 470 aa  90.1  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 441 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.75 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  24.06 
 
 		 466 aa  84  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  23.12 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  23.25 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  23.48 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  24.04 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.92 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.33 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.96 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.53 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  36.61 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.63 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  36.89 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 521 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  35.96 
 
 		 619 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 		 703 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.57 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 1017 aa  62  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.56 
 
 		 1891 aa  61.6  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  25.27 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  27.32 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.43 
 
 		 1021 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  22.4 
 
 		 1005 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.29 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.18 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.41 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.48 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  24.86 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  24.83 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  25.27 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.4 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.95 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  31 
 
 		 249 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.92 
 
 		 462 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  25.63 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.83 
 
 		 442 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.4 
 
 		 1942 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  24.04 
 
 		 554 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.11 
 
 		 606 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.11 
 
 		 606 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  36 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.18 
 
 		 1855 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.34 
 
 		 815 aa  54.7  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>