More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1822 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 936 aa  1917    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  74.84 
 
 		 933 aa  1441    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  84.42 
 
 		 930 aa  1647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  84.42 
 
 		 930 aa  1647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  85.64 
 
 		 935 aa  1667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  85.64 
 
 		 935 aa  1667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  77.34 
 
 		 937 aa  1487    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  84.53 
 
 		 930 aa  1647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  85.64 
 
 		 935 aa  1667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  39.63 
 
 		 935 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 981 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 953 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 966 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  35.11 
 
 		 966 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1088 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 843 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 965 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 838 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 987 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 907 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 841 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 836 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  34.18 
 
 		 853 aa  426  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 869 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 855 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 981 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 853 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 853 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 842 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 853 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.7 
 
 		 839 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 853 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 985 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 855 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 952 aa  406  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 873 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 912 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 944 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 907 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 873 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 974 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 975 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 938 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 901 aa  365  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.3 
 
 		 709 aa  365  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 817 aa  361  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 904 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 904 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 904 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 904 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 897 aa  349  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 948 aa  346  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 924 aa  341  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 946 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 957 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.38 
 
 		 914 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 869 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 966 aa  325  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 947 aa  324  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 951 aa  321  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 944 aa  320  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 891 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 875 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 929 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 935 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 910 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 951 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 924 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 924 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 924 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 872 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 967 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 876 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 855 aa  296  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.14 
 
 		 969 aa  296  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 961 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1009 aa  294  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 871 aa  293  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 973 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 869 aa  292  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 969 aa  290  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1015 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 940 aa  285  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 890 aa  280  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 861 aa  280  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 890 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 861 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 890 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 861 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 847 aa  278  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 852 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.46 
 
 		 899 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 895 aa  274  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 857 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 849 aa  268  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 956 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 868 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>