More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3475 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  84.58 
 
 		 390 aa  674    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  83.8 
 
 		 390 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  94.36 
 
 		 390 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 390 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  85.9 
 
 		 390 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  84.83 
 
 		 390 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  66.67 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  65.09 
 
 		 391 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  47.77 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  48.7 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  48.7 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  47.56 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  45.36 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  46.03 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  44.68 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  45.18 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  44.33 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  44.96 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  42.71 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  42.16 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  42.93 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  43.84 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  42.3 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  41.18 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  31.61 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 387 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  30.39 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 393 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  30.31 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 401 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  31.08 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.46 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.2 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  26.44 
 
 		 463 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 389 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.44 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  26.18 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.18 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  25.93 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.44 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.44 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  26.44 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.18 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.18 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>