More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4478 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  95.3 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  85.41 
 
 		 233 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  76.92 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  72.77 
 
 		 239 aa  358  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  72.89 
 
 		 239 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  74.78 
 
 		 230 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  72.77 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  75.11 
 
 		 230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  75 
 
 		 234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  75.57 
 
 		 228 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  72.89 
 
 		 231 aa  350  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  75.58 
 
 		 228 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  71.17 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  71.43 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  68.75 
 
 		 232 aa  332  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  68.47 
 
 		 227 aa  322  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  68.78 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  67.13 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  52.53 
 
 		 389 aa  245  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  50.9 
 
 		 226 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  47 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  47.3 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  51.72 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  48.82 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  50.92 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  51.58 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  51.58 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  51.58 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  51.12 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  47.51 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  51.13 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  45.24 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  48.29 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  46.49 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  46.51 
 
 		 223 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  45.33 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  47.77 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  47.77 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  45.37 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  46.26 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  36.12 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.89 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.99 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.73 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.14 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.67 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.67 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.67 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.51 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.44 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.97 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.69 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.94 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.56 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.02 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.16 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>