More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0090 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0090  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 353 aa  716    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131629  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0087  type II and III secretion system protein  88.5 
 
 		 209 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.804652  hitchhiker  0.00443687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  49.59 
 
 		 706 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  50.4 
 
 		 714 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  50.81 
 
 		 721 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  50.81 
 
 		 721 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  47.58 
 
 		 710 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  35.44 
 
 		 576 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  34.94 
 
 		 462 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  34.94 
 
 		 462 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  34.94 
 
 		 462 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  34.94 
 
 		 465 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  34.94 
 
 		 527 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  34.37 
 
 		 575 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  34.37 
 
 		 616 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  47.06 
 
 		 717 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  34.67 
 
 		 523 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  45 
 
 		 710 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  48.56 
 
 		 553 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  48.56 
 
 		 553 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  46.99 
 
 		 726 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  45.98 
 
 		 721 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  46.75 
 
 		 543 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  46.75 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  46.34 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  47.03 
 
 		 591 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  47.03 
 
 		 567 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  46.59 
 
 		 543 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  46.56 
 
 		 696 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  46.56 
 
 		 696 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  44.81 
 
 		 573 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  45.97 
 
 		 712 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  42.08 
 
 		 714 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  42.11 
 
 		 715 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  42.53 
 
 		 716 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  41.83 
 
 		 712 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  31.59 
 
 		 694 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  32.45 
 
 		 946 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  33 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  32.16 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  32.75 
 
 		 420 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  30.77 
 
 		 710 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  37.89 
 
 		 723 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  32.12 
 
 		 689 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  38.35 
 
 		 711 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  29.58 
 
 		 684 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  30.08 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  29.06 
 
 		 578 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  29.13 
 
 		 683 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  29.13 
 
 		 683 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  29.13 
 
 		 683 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  29.83 
 
 		 684 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  29.13 
 
 		 683 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  36.28 
 
 		 727 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  39.84 
 
 		 580 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  29.28 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  39.52 
 
 		 698 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  39.52 
 
 		 698 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  40.23 
 
 		 706 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  30.47 
 
 		 688 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  40.08 
 
 		 668 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.51 
 
 		 874 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  38.67 
 
 		 547 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  40.48 
 
 		 715 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  35.44 
 
 		 657 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.9 
 
 		 684 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  37.25 
 
 		 699 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  36.82 
 
 		 711 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  30.46 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.4 
 
 		 685 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  26.99 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  35.83 
 
 		 684 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  36.7 
 
 		 636 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  34.41 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  38.8 
 
 		 683 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.59 
 
 		 729 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.91 
 
 		 894 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  36.9 
 
 		 704 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  36.19 
 
 		 630 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  40 
 
 		 944 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  36.15 
 
 		 718 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  37.61 
 
 		 756 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  34.25 
 
 		 683 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 		 683 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.38 
 
 		 718 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  38.43 
 
 		 926 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  37.2 
 
 		 682 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  35.96 
 
 		 784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  36.55 
 
 		 682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  35.96 
 
 		 784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  37.02 
 
 		 422 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  27.55 
 
 		 706 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  34.16 
 
 		 655 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  35.83 
 
 		 682 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  34.96 
 
 		 692 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  28.68 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  29.53 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  34.22 
 
 		 729 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  32.91 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>