More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4508 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  58.28 
 
 		 592 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  55.74 
 
 		 592 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  58.85 
 
 		 593 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  57.6 
 
 		 592 aa  683    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  58.61 
 
 		 592 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  59.27 
 
 		 599 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1166    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  58.28 
 
 		 592 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  55.74 
 
 		 592 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  43.37 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  41.98 
 
 		 596 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  38.96 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  37.11 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.04 
 
 		 624 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 588 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.4 
 
 		 602 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.4 
 
 		 596 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.74 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.58 
 
 		 597 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.25 
 
 		 589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.71 
 
 		 591 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.9 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.97 
 
 		 596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.18 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.62 
 
 		 596 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.14 
 
 		 622 aa  297  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 		 607 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.51 
 
 		 609 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  34.06 
 
 		 592 aa  289  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.52 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.18 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.96 
 
 		 592 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.1 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.33 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.39 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.22 
 
 		 605 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.57 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.03 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.3 
 
 		 618 aa  273  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.39 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 588 aa  267  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 613 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.08 
 
 		 609 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.06 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.87 
 
 		 606 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.02 
 
 		 612 aa  263  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.28 
 
 		 591 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.4 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.52 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.63 
 
 		 609 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.55 
 
 		 602 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 619 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  30.33 
 
 		 602 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.33 
 
 		 602 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.2 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.57 
 
 		 588 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.25 
 
 		 613 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.29 
 
 		 616 aa  243  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.76 
 
 		 605 aa  240  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  30.93 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.15 
 
 		 632 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 590 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.76 
 
 		 619 aa  237  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.62 
 
 		 614 aa  237  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  29.34 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.82 
 
 		 606 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 593 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  29.6 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  28.8 
 
 		 620 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.61 
 
 		 641 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  28.21 
 
 		 594 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.43 
 
 		 621 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  31.36 
 
 		 593 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  31.62 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.07 
 
 		 588 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  31.13 
 
 		 579 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.57 
 
 		 591 aa  224  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.62 
 
 		 593 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  29.37 
 
 		 587 aa  223  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  29.76 
 
 		 590 aa  223  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  29.33 
 
 		 586 aa  223  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.29 
 
 		 591 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.39 
 
 		 609 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.52 
 
 		 634 aa  220  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.48 
 
 		 609 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.48 
 
 		 609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  32.25 
 
 		 603 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  31.61 
 
 		 591 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.48 
 
 		 609 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  29.29 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  31.54 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  28.37 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.43 
 
 		 583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.59 
 
 		 610 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.73 
 
 		 590 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.77 
 
 		 590 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  31.54 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>