More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1105 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
911 aa  1860    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  90.66 
 
 
785 aa  1421    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  43.37 
 
 
1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 
924 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
1105 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  66.57 
 
 
444 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  35.35 
 
 
934 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.4 
 
 
767 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  58.51 
 
 
1328 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.08 
 
 
1424 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  57.46 
 
 
454 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  56.96 
 
 
1215 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.88 
 
 
1068 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.69 
 
 
963 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  51.17 
 
 
1507 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.64 
 
 
1056 aa  366  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.86 
 
 
568 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.84 
 
 
771 aa  351  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  58.86 
 
 
568 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.99 
 
 
859 aa  350  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  33.44 
 
 
897 aa  348  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.52 
 
 
787 aa  347  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
953 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  47.23 
 
 
825 aa  343  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  33.29 
 
 
1288 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.52 
 
 
900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  48.24 
 
 
725 aa  337  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 
1324 aa  334  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
1185 aa  333  9e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.33 
 
 
1131 aa  329  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  52.94 
 
 
843 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  32.92 
 
 
829 aa  328  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.3 
 
 
992 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
1262 aa  321  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  50.69 
 
 
1044 aa  320  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
1088 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.67 
 
 
885 aa  312  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.33 
 
 
991 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  33.29 
 
 
822 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 
751 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  35.99 
 
 
672 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.88 
 
 
1186 aa  297  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
1050 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  34.17 
 
 
977 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  58.02 
 
 
919 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 
1128 aa  290  7e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  31.02 
 
 
845 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
814 aa  283  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  55.34 
 
 
284 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  31.35 
 
 
1125 aa  282  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.7 
 
 
899 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  47.93 
 
 
799 aa  281  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  50.52 
 
 
362 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.75 
 
 
843 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.95 
 
 
680 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
1283 aa  273  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  31.6 
 
 
849 aa  262  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.28 
 
 
801 aa  262  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  55.85 
 
 
311 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 
1000 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.24 
 
 
1309 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  28.98 
 
 
1500 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.81 
 
 
1404 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  41.03 
 
 
385 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.45 
 
 
1314 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.25 
 
 
675 aa  241  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
857 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
577 aa  235  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.76 
 
 
1212 aa  234  7.000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.6 
 
 
793 aa  233  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
443 aa  231  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  30.59 
 
 
838 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
1146 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  54.79 
 
 
481 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.05 
 
 
1383 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  31.52 
 
 
828 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.76 
 
 
1488 aa  210  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.53 
 
 
2145 aa  210  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  53.54 
 
 
212 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  28.37 
 
 
1509 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 
1311 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  39.9 
 
 
493 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
1136 aa  205  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 
1028 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.41 
 
 
1550 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  30.22 
 
 
713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.85 
 
 
1523 aa  197  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  36.83 
 
 
1290 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
669 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  54.64 
 
 
190 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
640 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
966 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  36.07 
 
 
732 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  34.32 
 
 
919 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  33.15 
 
 
1040 aa  180  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.91 
 
 
1010 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.6 
 
 
667 aa  177  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  33.14 
 
 
694 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 
469 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>