More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0245 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  430  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  29.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  32.77 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.1 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  19.87 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.45 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 376 aa  49.3  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 291 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  28 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>