More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0941 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 716 aa  1472    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  48.47 
 
 		 731 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  80.67 
 
 		 708 aa  1160    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  48.47 
 
 		 731 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  45.05 
 
 		 728 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  42.36 
 
 		 727 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  45.57 
 
 		 718 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  45.3 
 
 		 744 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 697 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 654 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 674 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 657 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 675 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.94 
 
 		 675 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 667 aa  359  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  30.89 
 
 		 682 aa  328  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 693 aa  316  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 663 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 656 aa  296  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 656 aa  275  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 690 aa  237  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 678 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.22 
 
 		 653 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 651 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 669 aa  117  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 647 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 673 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 737 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.55 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.25 
 
 		 634 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  25.67 
 
 		 779 aa  87.8  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.3 
 
 		 641 aa  87.4  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.54 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  20.19 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  21.67 
 
 		 638 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22.12 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.79 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 659 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 709 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  20.44 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  21.84 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  20.17 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  20.17 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 699 aa  73.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 836 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 742 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  20.17 
 
 		 666 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.05 
 
 		 611 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  20.76 
 
 		 666 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 788 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  19.33 
 
 		 764 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 804 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 815 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 788 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 749 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 707 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 611 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 656 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.33 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.82 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 698 aa  64.3  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  20.38 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>