More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4382 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 1006 aa  1958    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 983 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 982 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  35.91 
 
 		 916 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 970 aa  361  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 993 aa  357  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 967 aa  328  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 953 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 954 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 973 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 967 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  34.49 
 
 		 981 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 900 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 992 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 1084 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 1013 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 999 aa  186  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 1005 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  35.08 
 
 		 964 aa  151  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 895 aa  144  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 959 aa  137  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 1022 aa  127  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.24 
 
 		 1175 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 1198 aa  125  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 881 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 1227 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.23 
 
 		 1034 aa  119  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 1007 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  33.83 
 
 		 937 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.3 
 
 		 1403 aa  118  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1160 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.09 
 
 		 1422 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  33.6 
 
 		 1075 aa  115  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.2 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1105 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  33.01 
 
 		 1353 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 1141 aa  112  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 1141 aa  112  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 1429 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.49 
 
 		 1123 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.02 
 
 		 713 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  30.12 
 
 		 1051 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.1 
 
 		 1295 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 1141 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 1020 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 1048 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.46 
 
 		 1089 aa  107  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.22 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.53 
 
 		 1271 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.84 
 
 		 1054 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 1402 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 1118 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  29.21 
 
 		 1090 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  31.34 
 
 		 1118 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 1342 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.78 
 
 		 1071 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 1349 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 1349 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.84 
 
 		 1441 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.32 
 
 		 1122 aa  100  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.23 
 
 		 1134 aa  99.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 		 956 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.58 
 
 		 1109 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.04 
 
 		 1377 aa  98.2  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  32.79 
 
 		 1213 aa  98.2  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  32.79 
 
 		 1359 aa  98.2  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  32.52 
 
 		 1359 aa  98.2  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  32.52 
 
 		 1359 aa  98.2  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  32.52 
 
 		 1350 aa  97.8  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 1359 aa  97.8  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  28.21 
 
 		 1685 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.74 
 
 		 1132 aa  97.8  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 1349 aa  97.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 1348 aa  96.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  32.25 
 
 		 1359 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 864 aa  95.9  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.51 
 
 		 1093 aa  95.1  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.72 
 
 		 1121 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 1015 aa  95.1  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 1116 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.82 
 
 		 1697 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.7 
 
 		 1067 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 1138 aa  93.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.31 
 
 		 1080 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.12 
 
 		 921 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.88 
 
 		 1141 aa  92.8  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.38 
 
 		 919 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.72 
 
 		 1712 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.03 
 
 		 1149 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.89 
 
 		 1133 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1685 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1311 aa  90.1  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 		 1139 aa  89.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.11 
 
 		 1833 aa  89.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 919 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1685 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.57 
 
 		 1055 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 1400 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 1148 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>