More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1441 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  85.71 
 
 		 516 aa  833    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  73.82 
 
 		 528 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  76.89 
 
 		 528 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  75.47 
 
 		 526 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 523 aa  1031    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  78.75 
 
 		 527 aa  796    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  71.54 
 
 		 523 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  57.8 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  59.91 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  52.24 
 
 		 529 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  52.76 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  51.55 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  52.24 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  50.39 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  53.65 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  53.35 
 
 		 520 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  53.57 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  52.47 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  52.47 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  51.79 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  51.79 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  51.97 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  51.76 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  51.78 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.98 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  50.22 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49.47 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  45.83 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  44.85 
 
 		 527 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.12 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.9 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.71 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.79 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  49.04 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.87 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.01 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.01 
 
 		 493 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  44.62 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.61 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.4 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.49 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.67 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  42.48 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.57 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.51 
 
 		 501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.45 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.07 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.04 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41 
 
 		 471 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.36 
 
 		 498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.56 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  48.1 
 
 		 524 aa  313  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.7 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.3 
 
 		 523 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.01 
 
 		 457 aa  309  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.24 
 
 		 578 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.41 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.41 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  40.38 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.28 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.2 
 
 		 476 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.83 
 
 		 513 aa  306  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.61 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 		 496 aa  306  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  40.09 
 
 		 511 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.51 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.27 
 
 		 518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  41.63 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  39.92 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.59 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.33 
 
 		 511 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  36.9 
 
 		 522 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.65 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.11 
 
 		 511 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.38 
 
 		 476 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.02 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.12 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.61 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.6 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.88 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.7 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  39.02 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.83 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.52 
 
 		 466 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.78 
 
 		 475 aa  296  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  42.12 
 
 		 498 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.22 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  34.56 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.39 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  41.56 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.7 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.4 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.26 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.93 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.74 
 
 		 482 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  38.97 
 
 		 499 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.78 
 
 		 481 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  40.47 
 
 		 497 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  39.24 
 
 		 501 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>