More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1045 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  57.64 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  54.41 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  49.04 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  48.8 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  49.05 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 273 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  50.83 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 214 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 206 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.33 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  33.98 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  33.91 
 
 		 246 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  27.87 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  40.45 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
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NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
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