More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3394 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  100 
 
 		 411 aa  836    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  62.44 
 
 		 408 aa  541  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  35.18 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 432 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 503 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.9 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.9 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.77 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 504 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 453 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.16 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.03 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.22 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.5 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.64 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.21 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.89 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.25 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.36 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.6 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.75 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>