More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02748 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  48.71 
 
 		 861 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  52 
 
 		 877 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 		 870 aa  772    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  50.29 
 
 		 857 aa  807    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  48.3 
 
 		 869 aa  809    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  49.06 
 
 		 858 aa  774    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  50.99 
 
 		 851 aa  819    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 856 aa  1736    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  50.78 
 
 		 1015 aa  859    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  48.43 
 
 		 867 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  57.88 
 
 		 867 aa  922    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  48.84 
 
 		 867 aa  779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  40.68 
 
 		 823 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  39.91 
 
 		 864 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 868 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 872 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 800 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 843 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.61 
 
 		 800 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 803 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 797 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 847 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 795 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 853 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 853 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  32.93 
 
 		 795 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  34.07 
 
 		 797 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 948 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.3 
 
 		 784 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.37 
 
 		 848 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.34 
 
 		 840 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 803 aa  365  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 811 aa  363  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 793 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.44 
 
 		 793 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.86 
 
 		 821 aa  360  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  29.34 
 
 		 788 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 815 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 788 aa  350  6e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.87 
 
 		 884 aa  347  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 811 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.41 
 
 		 811 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 961 aa  344  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 815 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.14 
 
 		 870 aa  336  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 842 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 874 aa  333  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.64 
 
 		 799 aa  327  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.98 
 
 		 832 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 887 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 850 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 924 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 818 aa  294  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 947 aa  290  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 924 aa  287  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 918 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 804 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 833 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 849 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 858 aa  250  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 817 aa  244  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 987 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 795 aa  240  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 842 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 797 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 797 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 812 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 812 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 812 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 852 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 871 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 879 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 835 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 847 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 933 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 948 aa  167  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.56 
 
 		 839 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 885 aa  158  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 907 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.65 
 
 		 853 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 842 aa  144  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 813 aa  144  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 907 aa  144  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 841 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 853 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 853 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 843 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 855 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 853 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 875 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  38.58 
 
 		 816 aa  132  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 838 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 855 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 979 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>