More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01460 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  46.97 
 
 		 872 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  62.63 
 
 		 868 aa  1063    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 864 aa  1744    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  39.91 
 
 		 856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 870 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 851 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 858 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 861 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 867 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 867 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 857 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  39.17 
 
 		 823 aa  515  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  37.82 
 
 		 877 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  38.56 
 
 		 867 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 869 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.26 
 
 		 1015 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 853 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 800 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 843 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 803 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 797 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.62 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 797 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 948 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 812 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 853 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 840 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 817 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.8 
 
 		 784 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 847 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.42 
 
 		 961 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33.94 
 
 		 795 aa  363  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.33 
 
 		 870 aa  362  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.26 
 
 		 848 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 795 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.91 
 
 		 811 aa  356  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 803 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 924 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31 
 
 		 788 aa  347  6e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 933 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 874 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 788 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 811 aa  341  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 795 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 887 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 918 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  30.07 
 
 		 884 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.61 
 
 		 821 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.63 
 
 		 799 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 793 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 815 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.07 
 
 		 793 aa  314  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 948 aa  308  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.03 
 
 		 832 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 871 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 987 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 883 aa  294  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 811 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 815 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 804 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 850 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 835 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 924 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 842 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 818 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 947 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 833 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 847 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 816 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 849 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 858 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 813 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 842 aa  211  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 885 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 873 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 852 aa  178  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 867 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 867 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 867 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 879 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 841 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 867 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 838 aa  150  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.14 
 
 		 853 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 866 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.2 
 
 		 880 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1055 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.62 
 
 		 797 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 817 aa  131  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 897 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 907 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.9 
 
 		 839 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>