102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0088 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 390 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  69.36 
 
 		 373 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  71.19 
 
 		 399 aa  542  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  71.07 
 
 		 379 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  67.22 
 
 		 814 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  69.23 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  67.4 
 
 		 377 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  68.96 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  65.83 
 
 		 383 aa  521  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  68.06 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  67.78 
 
 		 393 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  65.07 
 
 		 783 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  66.76 
 
 		 783 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  62.5 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  58.29 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  48.6 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  47.89 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  51.49 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  51.09 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  50.54 
 
 		 373 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  48.79 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  47.98 
 
 		 376 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  44.21 
 
 		 382 aa  347  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  43.7 
 
 		 370 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  43.34 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.11 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.34 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  40.57 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.44 
 
 		 367 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 		 415 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  42.89 
 
 		 460 aa  280  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  41.64 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.39 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.16 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.11 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  41.55 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  38.03 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  38.42 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  40.56 
 
 		 381 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  40.48 
 
 		 395 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  40.71 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.5 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  38.69 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  38.32 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.99 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  37.83 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  37.18 
 
 		 413 aa  253  6e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  36.93 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  38.1 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  37.2 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  36.87 
 
 		 399 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  36.87 
 
 		 399 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  36.87 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 413 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  38.93 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  38.24 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.77 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.58 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  30.38 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  27.8 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.39 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.39 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.75 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  28.82 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.32 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.98 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.33 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.67 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  25 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  28.92 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  24.54 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  22.83 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.44 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.5 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.05 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.61 
 
 		 498 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>