More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1452 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 1793 aa  3561    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1987 aa  238  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.59 
 
 		 623 aa  195  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 		 1755 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.39 
 
 		 1264 aa  173  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  37.28 
 
 		 570 aa  145  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.6 
 
 		 466 aa  125  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 459 aa  119  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.3 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 459 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 		 468 aa  112  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  51.38 
 
 		 637 aa  107  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.32 
 
 		 466 aa  107  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  46.73 
 
 		 175 aa  96.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.37 
 
 		 478 aa  95.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  43.24 
 
 		 509 aa  95.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 261 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 525 aa  91.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 374 aa  90.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 193 aa  89.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 		 498 aa  89.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 263 aa  89.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.17 
 
 		 517 aa  89.4  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 445 aa  89  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 263 aa  89  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 537 aa  89  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  42.34 
 
 		 510 aa  89.4  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 294 aa  89  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 263 aa  89  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  45.13 
 
 		 286 aa  88.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 543 aa  88.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.84 
 
 		 656 aa  87.8  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  38.69 
 
 		 322 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  46.23 
 
 		 320 aa  87.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 544 aa  87  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.95 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 241 aa  86.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.84 
 
 		 670 aa  86.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  32.68 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 262 aa  86.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.37 
 
 		 669 aa  85.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 321 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 240 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  27.94 
 
 		 499 aa  84.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 673 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  45.71 
 
 		 420 aa  84.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 230 aa  84.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 671 aa  84.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  35.94 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 		 440 aa  83.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.81 
 
 		 422 aa  83.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 223 aa  83.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 668 aa  82.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.85 
 
 		 734 aa  82.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 648 aa  82.8  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.35 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  43.4 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 459 aa  82  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.26 
 
 		 261 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 403 aa  81.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.26 
 
 		 261 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 174 aa  81.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 412 aa  80.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.93 
 
 		 226 aa  80.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 217 aa  81.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 260 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 317 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 360 aa  80.5  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.05 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 464 aa  80.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 798 aa  79.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  42.72 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  38.02 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.45 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  40.35 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.44 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 335 aa  78.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 510 aa  78.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 		 225 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 319 aa  78.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.55 
 
 		 224 aa  78.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.94 
 
 		 320 aa  78.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  32.8 
 
 		 656 aa  78.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.51 
 
 		 641 aa  78.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40.91 
 
 		 330 aa  78.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.05 
 
 		 1026 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.7 
 
 		 239 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 242 aa  77.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 594 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 219 aa  77.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.97 
 
 		 260 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  35.54 
 
 		 464 aa  77  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.25 
 
 		 214 aa  77  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>