195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0642 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 692 aa  1359    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  62.28 
 
 		 683 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  55.44 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  46.08 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  48.55 
 
 		 442 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  35.87 
 
 		 782 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  45.64 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  39.24 
 
 		 265 aa  144  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.56 
 
 		 795 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  33.92 
 
 		 1628 aa  124  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  43.72 
 
 		 1067 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  35.16 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  41.87 
 
 		 1199 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  38.38 
 
 		 595 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  32.74 
 
 		 1462 aa  97.8  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  35.42 
 
 		 1633 aa  97.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  34.81 
 
 		 2068 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  52.17 
 
 		 277 aa  94.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.55 
 
 		 9585 aa  93.2  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  48.42 
 
 		 224 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  32.33 
 
 		 1795 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.91 
 
 		 3802 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  57.89 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  30.56 
 
 		 741 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  38.67 
 
 		 211 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  40.61 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  38.46 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  32.53 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.55 
 
 		 6885 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  37.72 
 
 		 231 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  48.51 
 
 		 2998 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  29.74 
 
 		 310 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.49 
 
 		 1172 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  33.17 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.95 
 
 		 3027 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.89 
 
 		 2170 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.48 
 
 		 1787 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  26.8 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  44.32 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  40.11 
 
 		 613 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  44.32 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  43.18 
 
 		 457 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.94 
 
 		 903 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  24.92 
 
 		 1131 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  33.51 
 
 		 918 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.85 
 
 		 1160 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  26.96 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  33.82 
 
 		 2334 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.62 
 
 		 1880 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28.9 
 
 		 804 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  26.61 
 
 		 2084 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  45.68 
 
 		 1645 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.89 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  34.1 
 
 		 1887 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  27.76 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  27.51 
 
 		 1135 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.13 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.05 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  33.94 
 
 		 667 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  25.56 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  27.64 
 
 		 2039 aa  64.3  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.92 
 
 		 3333 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  25.19 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  29.25 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  43.14 
 
 		 1401 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  24.79 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  27.34 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  33.02 
 
 		 484 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  31.45 
 
 		 2047 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.92 
 
 		 2286 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  40.18 
 
 		 1401 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.16 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  40.17 
 
 		 548 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  25.38 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.61 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1994 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  32.47 
 
 		 2052 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.06 
 
 		 1550 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  29.14 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  25.7 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  25.74 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  28.44 
 
 		 2011 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  22.74 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  24.79 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  24.79 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.04 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  25.93 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  25 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  33.66 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.74 
 
 		 2286 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1879 aa  57.4  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  26.17 
 
 		 759 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 1847 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  31.48 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  31.84 
 
 		 1363 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  34.64 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.49 
 
 		 999 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  32.08 
 
 		 1695 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>