21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1402 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1383    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  28.72 
 
 		 653 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  29.06 
 
 		 694 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  32.39 
 
 		 659 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  32.2 
 
 		 667 aa  127  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  28.31 
 
 		 700 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  28.81 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  36.49 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  36.69 
 
 		 611 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  26.58 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  33.17 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  34.64 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  34.01 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  33.2 
 
 		 511 aa  62  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  27.63 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  32.23 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2712  hypothetical protein  32.09 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  32.77 
 
 		 265 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 683 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 525 aa  44.3  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  36.51 
 
 		 238 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>