More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3833 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  91.71 
 
 		 1450 aa  1154    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 760 aa  1504    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  39.14 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1827 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.76 
 
 		 1034 aa  334  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 1005 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 578 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 3145 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  44.89 
 
 		 412 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  42.45 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 767 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  46.47 
 
 		 529 aa  292  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  39.79 
 
 		 703 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 688 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 780 aa  287  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 1212 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 		 601 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.11 
 
 		 689 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  41.99 
 
 		 556 aa  279  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.93 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 523 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  42.44 
 
 		 608 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  39.16 
 
 		 648 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 602 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 955 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.03 
 
 		 454 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 653 aa  269  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  37.97 
 
 		 653 aa  269  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  39.9 
 
 		 872 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  41.47 
 
 		 714 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 		 472 aa  264  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.32 
 
 		 740 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 620 aa  258  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  39.54 
 
 		 505 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 935 aa  250  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  39.02 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 		 546 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 646 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 457 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 747 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 649 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 649 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.12 
 
 		 1077 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  40.11 
 
 		 387 aa  243  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 484 aa  241  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.43 
 
 		 1677 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  37.9 
 
 		 615 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.42 
 
 		 1764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 558 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  36.89 
 
 		 503 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  39.81 
 
 		 473 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 662 aa  227  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 592 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.86 
 
 		 360 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1454 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 520 aa  220  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1451 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 		 1073 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 607 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 545 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 		 636 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.12 
 
 		 626 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 681 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  39.83 
 
 		 360 aa  211  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  36.83 
 
 		 389 aa  210  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  39.28 
 
 		 527 aa  210  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.85 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  34.22 
 
 		 630 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 		 550 aa  207  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  39.94 
 
 		 385 aa  206  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 595 aa  204  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.47 
 
 		 626 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 559 aa  200  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 583 aa  200  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 611 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 636 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 		 626 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 		 545 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 639 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 607 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 545 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 579 aa  194  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 		 604 aa  193  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  33.48 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 		 600 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>