More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0166 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  28.1 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.37 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  29.24 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.39 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  38.2 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.35 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>